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Plus de 6000 gènes de résistance aux antibiotiques découverts dans le microbiote intestinal

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Prediction of the intestinal resistome by a three-dimensional structure-based method Etienne Ruppé1,2, Amine Ghozlane1,3,4, Julien Tap1,16, Nicolas Pons1, Anne-Sophie Alvarez1, Nicolas Maziers1, Trinidad Cuesta5, Sara Hernando-Amado5, Irene Clares5, Jose Luís Martínez5, Teresa M. Coque6,7,8, Fernando Baquero6,7,8, Val F. Lanza6,7, Luis Máiz9, Tiphaine Goulenok10, Victoire de Lastours2,10, Nawal Amor10, Bruno Fantin2,10, Ingrid Wieder11, Antoine Andremont2,11, Willem van Schaik12,13, Malbert Rogers12, Xinglin Zhang12, Rob J. L. Willems12, Alexandre G. de Brevern14, Jean-Michel Batto1, Hervé M. Blottière1, Pierre Léonard1, Véronique Léjard1, Aline Letur1, Florence Levenez1, Kevin Weiszer1, Florence Haimet1, Joël Doré1, Sean P. Kennedy1,4 and S. Dusko Ehrlich1,15   1MGP MetaGénoPolis, INRA, Université Paris-Saclay, Jouy en Josas, France 2IAME, UMR 1137, INSERM, Paris Diderot University, Sorbonne Paris Cité, Paris, France 3Institut Pasteur - Bioinformatics and Biostatistics Hub - C3BI, USR 3756 IP CNRS, Paris, France 4Institut Pasteur - Biomics - CITECH, Paris, France 5Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid, Spain 6Servicio de Microbiología Instituto, Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria, Madrid, Spain 7CIBER en Epidemiología y Salud Pública, Madrid, Spain 8Unidad de Resistencia a Antibióticos y Virulencia Bacteriana, Madrid, Spain 9Unit for Cystic Fibrosis, Ramon y Cajal University Hospital, Madrid, Spain 10Internal Medicine Department, Beaujon Hospital, AP-HP, Clichy, France 11Bacteriology Laboratory, Bichat-Claude Bernard Hospital, AP-HP, Paris, France 12Department of Medical Microbiology, University Medical Center Utrecht, Utrecht, the Netherlands 13Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, Edgbaston, Birmingham, UK 14INSERM UMR_S 1134, Paris Diderot University, Sorbonne Paris Cité, Université de la Réunion, Université des Antilles, INTS, GR-Ex, Paris, France 15Centre of Host Microbiome Interactions, King’s College, London, UK 16Danone Nutricia Research, Palaiseau, France   Nature Microbiology, 26 novembre 2018 Doi : 10.1038/s41564-018-0292-6

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