Visualisation du microbiote intestinal humain (rouge) au sein de la couche de mucus (verte) située à la surface de l’intestin. © Benoit Chassaing/Institut Cochin

A l’occasion de la journée mondiale du microbiome, l’Inserm vous propose de redécouvrir certains de ses contenus, ainsi que l’actualité du Programme de recherche Systèmes Alimentaires, Microbiomes et Santé, que l’Institut co-pilote avec INRAE.

Les microbiomes sont des écosystèmes dans lesquels cohabitent des microorganismes comme les bactéries, les virus, les parasites et les champignons, qui vivent en symbiose avec leur hôte dans un environnement donné. La constitution et la composition de ces microbiomes est propre à chaque individu et évoluent tout au long de la vie.

On parle de microbiote, lorsque ces micro-organismes cohabitent au même endroit, par exemple dans les intestins, au niveau vaginal ou encore dans la bouche.

Au cours de la dernière décennie, de nombreux travaux de recherche ont montré que l’équilibre du microbiome, et donc du nombre et de la diversité des micro-organismes présents dans notre organisme, était essentiel à la santé des individus. Un déséquilibre (scientifiquement appelé « dysbiose ») peut être à l’origine du développement de maladies chroniques telles que les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), mais aussi d’ obésité, et impliqué dans des troubles neurodégénératifs, neuropsychiatriques et neurocomportementaux.

Des facteurs, tels que l’alimentation, le mode de vie, l’exposition aux polluants… ont   été mentionnés comme des facteurs pouvant être à l’origine des perturbations du microbiome. Cependant, malgré les avancées scientifiques majeures déjà effectuées, il est nécessaire de continuer à explorer le rôle de ces facteurs et les mécanismes associés au vu de la complexité de notre organisme.

A l’Inserm, plusieurs équipes sont mobilisées sur le sujet et tentent de déterminer les facteurs déclenchant la transition d’un microbiome «sain » vers un état « de dysbiose ». La thématique a par ailleurs bénéficié d’un nouveau souffle en 2023, alors que l’Inserm s’est vu confié le co-pilotage du Programme de recherche Systèmes Alimentaires, Microbiomes et Santé, avec INRAE.

Le Programme de recherche Systèmes Alimentaires, Microbiomes et Santé

L’ambition du Programme de recherche est de contribuer à prévenir et traiter les maladies inflammatoires chroniques et tendre vers une médecine personnalisée à travers le tryptique environnement-microbiomes-santé et de concourir à la conception et à l’évaluation des politiques publiques en matière de consommation et comportement alimentaires.

Ce Programme de recherche doté de 58 millions d’euros d’aide de l’Etat français « France 2030 » déployés sur 7 ans, a pour objectif de financer des projets de recherche structurants et pluridisciplinaires pour atteindre un rôle de premier plan au niveau national et international.

Toutes les actualités du programme sont disponibles sur son site internet.

Pour aller plus loin sur le microbiome :

• Lire le dossier Inserm sur le microbiote intestinal
• Regarder la vidéo Canal Détox : Le microbiote, un deuxième cerveau, vraiment ?
• Consulter en ligne la bande dessinée de l’Inserm : Voyage au cœur du microbiote
• Consulter les récents communiqués de presse publiés par l’Inserm à ce sujet :
  • Maladies cardiovasculaires : alimentation, microbiote, immunité, tout est lié !
  • La composition du microbiote digestif influence la réponse immunitaire anti-tumorale après une allogreffe de cellules souches hématopoïétiques

• Consultez les récentes actualités publiées sur le site internet de l’Inserm :
  • Une cible méconnue des probiotiques aiderait à limiter la survenue de maladies métaboliques
  • Anorexie mentale : l’horloge interne des femmes pourrait les rendre plus vulnérables
  • Cancer colorectal : une toxine bactérienne impliquée dans la chimiorésistance

Globules rouges en forme de faucille (drépanocytose) ©Inserm/Chevance de Boisfleury, Anne-Marie

Première maladie génétique en France et dans le monde, la drépanocytose affecte l’hémoglobine des globules rouges. Cette maladie génétique se manifeste notamment par une anémie, des crises douloureuses et un risque accru d’infections.

Si les traitements actuels ont permis d’augmenter grandement l’espérance de vie des patients affectés, ils restent encore limités. La recherche poursuit donc ses efforts pour les améliorer, voire traiter la maladie à la source, là où naissent les globules rouges.

A l’approche de la journée mondiale de lutte contre la drépanocytose, l’Inserm vous propose de découvrir ou redécouvrir certains contenus publiés au sujet de l’avancée des connaissances sur cette maladie.

• Pour en savoir plus sur la drépanocytose et les enjeux actuels de la recherche sur cette maladie. Lire le dossier : Drépanocytose, La maladie génétique la plus fréquente en France
• Une thérapie génique prometteuse contre la drépanocytose et la bêta-thalassémie – Lire le communiqué de presse du 25 janvier 2022

• Réécouter l’émission La Science CQFD, en partenariat avec le magazine de l’Inserm : Drépanocytose : les liens du sang / consulter le dossier : Le sang : soigner ses maladies et plus encore du magazine de l’Inserm n°57
• Enfin, pour en savoir plus sur l’hémoglobine, lire le « C’est quoi ? » : Bon sang, mais c’est bien sûr – C’est quoi l’hémoglobine ?

© iStock

Les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (ou MICI) regroupent la maladie de Crohn (MC) et la rectocolite hémorragique (RCH). Toutes deux se caractérisent par une inflammation de la paroi d’une partie du tube digestif, due à une dérégulation du système immunitaire intestinal. Cette inflammation incontrôlée est responsable de lésions tissulaires et de la chronicité de la maladie.

Son origine semble résulter de la combinaison complexe de facteurs environnementaux, associés à une susceptibilité génétique du patient et à la réactivité particulière de son système immunitaire. 

A l’approche de la journée mondiale des MICI, l’Inserm vous propose de consulter une liste de contenus publiés récemment sur ces maladies qui concerneraient plus de 200 000 personnes en France.

• Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) : Contrôler les symptômes pour retrouver une qualité de vie satisfaisante – Lire le dossier Inserm 
• Qu’est-ce que les MICI ? Quel lien entre microbiote et MICI ? Quels sont les traitements actuels pour améliorer la qualité de vie des patients ? Quelles sont les recherches en perspective ? Existera-t-il un jour un vaccin ?

Revoir la conférence Inserm « MICI, chronique d’une maladie intestinale » du 29 juin 2021

• MICI : Une seule protéine vous manque et tout est dérégulé : un article à lire dans le magazine de l’Inserm numéro 56

L’asthme est une maladie respiratoire fréquente qui touche plus de 4 millions de personnes en France. Inhalateur © AdobeStock

L’asthme est une maladie respiratoire fréquente qui touche plus de 4 millions de personnes en France. La compréhension des mécanismes biologiques à son origine est au cœur des travaux de recherche de plusieurs équipes à l’Inserm. Retour sur deux études récentes ainsi que d’autres contenus publiés par l’Inserm sur le sujet.

Asthme : Portraits-robots des personnes à risque

De nombreuses études décrivent des liens entre différents paramètres de l’environnement, de la petite enfance, des habitudes de vie ou encore du cadre social, et le risque de développer de l’asthme. Cependant, on connaît encore mal la façon dont ces différents facteurs interagissent les uns avec les autres. Tout laisse à penser que la combinaison de certains d’entre eux accroît encore davantage le risque de survenue de cette inflammation chronique des bronches.

C’est pourquoi une équipe de scientifiques à l’Institut pour l’avancée des biosciences de Grenoble (équipe épidémiologie environnement appliqué au développement de la santé respiratoire) s’est penchée sur une large base de données relatives à l’environnement et au statut asthmatique de milliers de volontaires.

L’analyse de cet ensemble d’informations et le rapprochement de différents paramètres a permis d’identifier trois profils types d’expositions précoces à risque :

• avoir été soumis à un tabagisme passif important au cours de la petite enfance, plus que la moyenne, et avoir vécu avec des chiens ;
• avoir des paramètres de naissance défavorables (naissance prématurée et/ou par césarienne) puis avoir été gardé en crèche en milieu urbain ;
• appartenir à une fratrie d’au moins 3 enfants et avoir été allaité.

Nouvelle étape franchie dans le développement d’un vaccin efficace contre l’asthme allergique

Les acariens sont la bête noire des personnes souffrant d’asthme allergique (qui représentent 50 % des cas d’asthme).  A l’heure actuelle, les corticoïdes inhalés sont les médicaments de référence pour contrôler l’asthme. Cependant, dans le cas d’asthme allergique sévère, ce traitement ne suffit pas toujours. Il faut alors avoir recours à des traitements par anticorps monoclonaux thérapeutiques ciblant justement les IgE ou les voies IL-4 et IL-13. Or ces médicaments sont très onéreux et contraignent les patients à effectuer des injections pendant des années, voire tout au long de leur vie.

Une équipe de recherche a donc développé un vaccin qui induit la production d’anticorps qui s’attaquent justement aux cytokines IL-4 et IL-13, et confère une protection durable dans des modèles d’asthme allergique. Les résultats, publiés dans la revue Allergy, ouvrent la voie à l’organisation d’un essai clinique.

Pour aller plus loin sur le sujet :

• Consulter le dossier sur l’asthme : Une inflammation chronique des bronches de mieux en mieux contrôlée
• Assister à l’émission « 30 minutes Santé » du mardi 7 mai à 20h30 qui sera consacrée à l’asthme et publiée sur la chaîne YouTube de l’Inserm.

Anopheles gambiae lors d’un repas sanguin. © Équipe, “Réponse immunitaire chez le moustique anophèle vecteur du paludisme”. Unité de recherche Inserm U963, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IBMC), Strasbourg.

La journée mondiale de lutte contre le paludisme est organisée tous les ans le 25 avril. Si des progrès ont été faits au cours des dernières décennies pour réduire son incidence ainsi que la mortalité, et pour améliorer la prise en charge, le paludisme touche encore des millions de personnes.
Comme le souligne l’OMS, 247 millions de cas de paludisme ont été rapportés dans le monde en 2021. Le nombre estimé de décès imputables à cette maladie s’est élevé à 619 000 cette année-là.
Pourtant, il s’agit d’une pathologie évitable et dont on peut guérir. Les efforts de recherche fournis par des scientifiques du monde entier, dont des équipes de l’Inserm, contribuent un peu plus chaque jour à améliorer la situation.
Retour sur certains contenus récemment publiés par l’Inserm au sujet de cette maladie.

Paludisme : une maladie parasitaire essentiellement transmise par le moustique

Le paludisme est une maladie parasitaire, transmise par un moustique. Elle se manifeste généralement par des symptômes semblables à ceux de la grippe, mais peut entraîner des complications graves, voire le décès du malade.

Au niveau mondial, la mortalité associée à cette maladie ne se compare qu’à celle due à la tuberculose ou au sida. L’enjeu immédiat est d’élargir l’accès à des traitements efficaces et aux moyens de prévention existants pour les populations qui vivent dans les régions où le paludisme est endémique. Parallèlement, la recherche travaille à la mise au point de nouveaux traitements préventifs, curatifs et/ou de vaccins, qui permettront peut-être, un jour, d’éradiquer la maladie.

Lire le dossier sur le paludisme sur inserm.fr

Paludisme : rigidifier les globules rouges infectés pour stopper la transmission de la maladie

Dans une étude publiée en 2023 dans la revue Nature Communications  une équipe de recherche s’est intéressée aux globules rouges infectés par le parasite du paludisme, et a explicité les mécanismes de filtration du sang par la rate. Elle a identifié deux médicaments susceptibles de décupler l’efficacité de cette filtration. Les globules rouges infectés seraient alors retenus dans la rate pour y être détruits et éliminés, stoppant ainsi la transmission de la maladie.

Paludisme : identification d’une machinerie moléculaire essentielle à la transmission par le moustique

Une équipe de recherche dirigée par Olivier Silvie, et associant des chercheurs et chercheuses de l’Inserm et de Sorbonne Université, a combiné une approche génétique originale à une technique de microscopie électronique tridimensionnelle et a identifié ainsi un complexe de protéines essentiel à la transmission du paludisme (Vidéo à visualiser sur le compte Instagram de l’Inserm). Ce complexe, appelé AMA1-RON, est nécessaire non seulement pour l’invasion des globules rouges, mais aussi pour l’infection des cellules hépatiques et pour la colonisation des glandes salivaires chez le moustique. Ce travail révèle de nouveaux aspects des interactions hôte-parasite au cours du paludisme. Les résultats ouvrent de nouvelles pistes pour le développement de stratégies antipaludiques visant à bloquer la transmission du paludisme. Ils font l’objet d’une publication dans la revue Plos Pathogens.

Pour plus d’infos, lire notre article : https://presse.inserm.fr/breve/paludisme-identification-dune-machinerie-moleculaire-essentielle-a-la-transmission-par-le-moustique/

Pour aller plus loin : consulter le grand angle du numéro 49 du magazine de l’Inserm consacré aux Zoonoses, les maladies infectieuses d’origine animale.